人工诊疗微生物（Therapeutic synthetic microbes）是一种新型的、安全的、有效的个体化“智能”药物，它通过人工从头合成或改造微生物（如细菌、噬菌体与病毒）并使其获得全新的生物功能，用于人类疾病诊断与治疗。
人工诊疗微生物是籍由合成生物学与人体微生物组两大热门领域的交叉汇聚而催生，目标是将合成生物学取得的科学与技术突破在医疗产业快速转化。人工诊疗微生物可以从多个方面维护人体健康，例如（1）人工噬菌体可以特异性地攻击病原菌，特别是多重耐药性的病原菌感染；（2）人工肿瘤靶向细菌、人工溶瘤病毒等可以有效攻击癌细胞，治疗肿瘤；（3）人工噬菌体或人工细菌可以“编辑”人体微生物组，行使特定代谢功能，干预人体微生物混乱造成的疾病。
拟建的工程实验室将通过建立国内首个完整的、自动化、高通量SynBioFoundry（合成生物学自动化合成车间），快速合成、进化人工诊疗微生物，开展个性化药物研发。技术平台在完善合成生物学元件库的同时，将全面融合实验室成员在微生物生理学、微生物组学、生物信息学、基因组编辑、代谢途径设计调控、分析方法、疾病模型等方面的研究基础。本实验室的建设，不仅将率先在我国建立起自动化、高通量的合成生物学技术平台，还将大大加快人工诊疗微生物作为个性化药物的研发过程，在我市医疗健康产业快速转化，维护人们身体健康。